全世界を股にかけ暗躍する国際犯罪組織・クライムが日本に狙いをつけ、続々とデビルロボット=機械生物を送り込んで来た。国際科学特捜隊日本支部長官の鯨井は最強のサイボーグ部隊の編成を開始、自ら隊長を名乗り4人のメンバーを選出した。改造手術を受けた4人は、強化カプセルでエネルギーをチャージされることで、それぞれ核・電気・重力・磁力のパワーを操る戦士に変身、ジャッカー電撃隊としてクライムの野望を打ち砕いていく。だが、クライムの真のボスで宇宙人のシャインは、犯罪で稼いだ資金を元手に世界征服へと乗り出した。侵略ロボット第1号・アトミック魔女に歯が立たず窮地に陥ったジャッカーたち。そこへ4大パワーを操る白い鳥人ビッグワンが現れ、彼らを救った。最強のサイボーグであるビッグワンを行動隊長に迎えたジャッカー電撃隊はクライムとの最終決戦へ臨む。
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